VLC로 한글 자막을 보려면 다음과 같이 하면 된다.
자막 트랙 설정

자막 트랙(Subtitles track) 값을 0으로 설정한다("고급 선택사항"을 선택해야 보임). 이렇게 해야 재생할 때 바로 자막이 보인다.
자막 인코딩 설정

자막 인코딩(Subtitles text encoding) 값을 CP949로 설정한다(EUC-KR로 해도 될 것 같은데 글씨가 깨짐).
글꼴 지정

글꼴(Font)을 고른다(한글 글꼴이어야 함).
선택사항

필요하다면 자막 파일을 찾는 방법을 설정한다(Subtitle autodetection fuzziness).
덧. VLC는 흔히 말하는 통합자막을 구별하지 못한다(자막에 여러 말로 된 자막이 있어도 맨 앞에 있는 것만 읽음). VLC로 여러 말로 된 자막을 보려면 파일을 나눠야 한다. 예를 들어 Example.avi, Example.smi, Example_eng.smi 가 있으면 자막 트랙이 두 개가 된다.
덧 둘. 개인적으로 한국어화해서 쓰고 있는데 필요하면 파일(vlc.mo)을 내려받아 VLC를 설치한 디렉토리의 "locale\ko\LC_MESSAGES"에 복사하세요. 이 글을 몇 분이나 보실지 모르겠지만 써보고 피드백을 좀 주셨으면 좋겠습니다. 그리고 vlc.po 파일입니다.